Erklärt: So funktioniert der Coronavirus (COVID-19)-Test

Wie sucht der PCR-Test nach dem Virus in Abstrichproben? Wie lange dauert es? Wie viele Proben testet Indien täglich und kann es mehr testen? Wenn ja, warum wurde es noch nicht hochskaliert?

Indien führt derzeit eine zweistufige Echtzeit-PCR zum Testen auf SARS-COV-2 durch. (Reuters)

Was ist der diagnostische Test für das neuartige Coronavirus, das COVID-19 verursacht?

Der Indian Council of Medical Research (ICMR) hat ausgewiesene Labors verwendet den herkömmlichen Echtzeit-Polymerase-Kettenreaktionstest (PCR), der mit einem Tupfer aus dem Rachenraum, einer flüssigen Probe aus den unteren Atemwegen oder einer einfachen Speichelprobe durchgeführt wird. Solche Tests werden häufig beim Nachweis von Influenza-A-, Influenza-B- und H1N1-Viren verwendet.

Was ist der PCR-Test?

Es verwendet eine Technik, die Kopien eines DNA-Segments erstellt. „Polymerase“ bezieht sich auf die Enzyme, die die Kopien der DNA herstellen. Bei der „Kettenreaktion“ werden die DNA-Fragmente exponentiell kopiert – eines wird in zwei kopiert, die beiden werden in vier kopiert und so weiter. Kary Mullis, der amerikanische Biochemiker, der die PCR-Technik erfunden hat, wurde 1993 mit dem Nobelpreis für Chemie ausgezeichnet.

SARS-COV-2 ist jedoch ein Virus aus RNA, das in DNA umgewandelt werden muss. Dazu beinhaltet die Technik einen Prozess namens reverse Transkription. Ein Enzym der „reversen Transkriptase“ wandelt die RNA in DNA um. Anschließend werden Kopien der DNA erstellt und amplifiziert. Ein fluoreszierender DNA-bindender Farbstoff, der Sonde genannt wird, zeigt das Vorhandensein des Virus an. Der Test unterscheidet auch SARS-COV-2 von anderen Viren.

Wie lange dauert der PCR-Prozess?

Echtzeit-PCRs haben die Zeit zum Testen von Proben von etwa 6 Stunden zuvor auf 4,5 Stunden verkürzt, sagte der ICMR-Wissenschaftler Dr. R. R. Gangakhedkar. Die Gesamtdurchlaufzeit – von der Entnahme der Proben bis zur Zustellung des Berichts – beträgt jedoch etwa 24 Stunden und sollte geringer sein, sagte er.

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Wie wird der Test in Indien durchgeführt?

Indien führt derzeit eine zweistufige Echtzeit-PCR durch, um auf SARS-COV-2 zu testen, sagte Dr. V. Ravi, Senior Professor und Leiter der Neurovirologie von NIMHANS. In der ersten Phase sollen genetische Elemente nachgewiesen werden, die bei menschlichen Coronaviren vorkommen und in der Probe möglicherweise vorhanden sind. Die zweite Stufe dient dazu, auf bestimmte Gene zu testen, die nur im SARS-COV-2-Virus vorhanden sind.

Bis Anfang März ist die Erstscreening Tests zur Überprüfung auf jede Art von Coronavirus wurden von allen Labors durchgeführt, aber die bestätigende PCR wurde nur vom National Institute of Virology in Pune durchgeführt. Anschließend übertrug NIV Pune die Technologie (für die Bestätigung erforderliche Reagenzien) an alle Labore, sodass keine Probe bis nach Pune benötigt werden musste. Dies hat die Zeit zum Testen der Proben verkürzt, sagte Dr. Ravi.

Coronavirus-Tests: In dieser Abbildung vom 17. März 2020 ist in Reagenzgläsern, die mit dem Coronavirus ( COVID-19 ) gekennzeichnet sind, gefälschtes Blut zu sehen. (Reuters-Illustration: Dado RuvicO

Testet Indien genug Zahlen?

Indien hat die Kapazität, täglich 10.000 Proben zu testen, und testet derzeit etwa 600-700. Im Vergleich dazu testet Südkorea, das eine ähnliche Durchlaufzeit hat, Berichten zufolge täglich bis zu 20.000 Proben, insbesondere mit Modellen wie seinen Durchfahrtsprüfanlagen.

Die Regierung argumentiert, dass es in diesem Stadium nicht notwendig ist, jede Person zu testen. Das Land testet die Kohorte, die es derzeit testen muss, sagte Dr. Gangakhedkar. Wenn Sie eine lokalisierte Übertragung verwenden, testen wir genug. Wenn Sie glauben, dass es eine Community-basierte Übertragung gibt, ist dies ein anderes Problem. Es gebe immer noch keine Beweise dafür, dass wir nicht wissen, wie der Indexfall diese Infektion erworben hat, sagte er.

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Wir wollen keine wahllosen Tests machen, weil jetzt jeder nach einem Test fragt. Irgendwo müssen wir also rationalisieren … aber es ist auch wichtig, ein Auge darauf zu haben, damit wir die Übertragung durch die Gemeinschaft nicht verpassen, sagte die ICMR-Wissenschaftlerin Dr. Nivedita Gupta letzte Woche während einer Pressekonferenz.

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Was wird die Strategie sein, wenn eine Übertragung durch die Gemeinschaft stattfindet?

ICMR führt eine Überwachung auf Anzeichen einer Übertragung durch die Gemeinschaft durch, wobei jedes der 52 indischen Testlabors 20 Stichproben von Patienten mit schwerer akuter Atemwegsinfektion (SARI) testet. Der „erste Schnitt“ dieser Tests wird voraussichtlich am Mittwoch veröffentlicht. ICMR sagte, dass die Strategien der Regierung für den Fall, dass bei diesen Überwachungstests ein Fall einer Übertragung durch die Gemeinschaft aufgedeckt wird, völlig anders sein werden.

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Gibt es Hindernisse für die Skalierung von Tests?

Die Kosten sind ein potenzielles Hindernis, meinen einige Experten. ICMR-Beamte hatten auf einer Konferenz gesagt, dass die Kosten für einen Primärtest auf COVID-19 1.500 Rupien betragen. Wenn ein zweiter Test durchgeführt werden soll, um die Ergebnisse des ersten Tests zu bestätigen, betragen die Gesamtkosten etwa 5.000 Rupien. Einer der Beamten hatte auch gesagt, dass die verwendeten Sonden, die aus Deutschland importiert werden, ein limitierender Faktor seien.

Während die Zahl der Testzentren erhöht wurde, sind auch die Importe von Sonden in die Höhe geschossen. Letzte Woche wollte Indien rund 200.000 Sonden importieren, während Dr. Gangakhedkar am Montag sagte, die Regierung plane, rund eine Million Sonden zu importieren.

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Könnte Indien die Dinge anders machen?

Was Indien begonnen hatte, ist genau das, was für ein Land empfohlen wurde, in das die Krankheit importiert wurde, so der Geschäftsführer des Translational Health Science and Technology Institute India, Dr. Gagandeep Kang. Tests und Nachuntersuchungen von Personen, die in das Land einreisen, und die Überwachung von Personen, mit denen sie in Kontakt gekommen sind, sind jedoch ein vernünftiger und angemessener Ansatz, wenn das einzige Risiko darin bestand, die Krankheit einzuschleppen und die Nachsorge und Tests 100 . betrugen %, Sie sagte.

Aber was passieren kann, ist, dass Sie bei dieser Infektion abstoßen können, noch bevor Sie Symptome entwickeln, und in sehr wenigen Fällen haben Sie möglicherweise nie Symptome, sodass Sie sie möglicherweise auf andere Menschen übertragen, ohne zu wissen, dass Sie infiziert sind, sagte sie. Diese Art von Komplexität … macht es notwendig, über eine Backup-Strategie nachzudenken, um zu sehen, ob Sie tatsächlich etwas verpasst haben, sagte sie. Es gibt noch mehr, was wir tun könnten.

Wird die ICMR-Überwachung helfen?

Die Entscheidung des ICMR ist ein guter Schritt, aber es gibt Regionen, die eine solche Übung dann auslassen würde, sagte Dr. Kang. Wenn Sie jede Woche Proben aus jedem Influenza-Labor testen und auch nur einen positiven Befund finden, bedeutet dies, dass Sie viel verpasst haben, sagte sie.

Laut Dr. Kang ist es möglich, mathematische Modelle zu verwenden, um zu verstehen, was der Regierung eine vernünftige Chance geben würde, festzustellen, ob es bereits eine Übertragung durch die Gemeinschaft gibt. Ich fände es großartig, ein Modell wie in Singapur zu haben, bei dem jeder Arzt, der einen klinischen Verdacht hatte, auch wenn er nicht in die Beschreibung passte, seine Patienten zu einem Test schicken darf, fügte sie hinzu.

– Eingaben von Kaunain Sheriff M

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